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Multi-Omics多组学数据的整合分析实战系列讲座(2015年期)—蛋白质组学

时间:2015/01/05-2015/01/07
地点:浙江省嘉兴市嘉善县罗星阁君澜宾馆
地区:
主办单位:上海博苑生物科技有限公司

会议简介

 

 2015年期蛋白质组学培训班开始接受报名,本期讲座分为,以实际案例上机为主,学习蛋白质组学数据的实用分析方法和图表绘制方法。特邀讲师均为在蛋白质组实验和生物信息方面拥有十余年的科研项目经验的专家,培训旨在通过实践学习组学数据的分析方法,解读生物学意义以及SCI论文释疑。

主办单位

上海博苑生物科技有限公司(博苑多维组学技术服务中心)

协办单位

金弗康生物科技(上海)有限公司

浙江欧胜生物科技有限公司

上海康昱盛信息科技有限公司

支持单位

中国归谷科技园

张江高科技园区(江桥经济城)

赛默飞世尔科技

时间、地点:

培训时间:2015年1月5日(周一)至1月7日(周三)

培训地点:浙江省嘉兴市嘉善县罗星阁君澜宾馆

讲课师资:

  • 刘骁:博士,金弗康生物CTO,上海市浦江人才获得者,德国批生物信息学专业本硕博毕业生。2002至今一直致力于从生物信息算法开发到生物大数据转化的研究和应用。参与主持的德国,美国和中国的生物信息项目百余项。在组学整合分析和系统生物学方面有丰富的经验。

  • 沈诚频:博士,毕业于复旦大学,并在美国麻省理工大学做访问学者两年。具有深厚的蛋白质组学及系统生物学研究背景。现为Progenesis samespots、Mascot、Scaffold、IPA等多款蛋白质组学经典分析软件的产品专家、对蛋白2D Gel/DIGE分析与处理,质谱鉴定及定量分析,以及基于蛋白质组学的生物通路分析,相互作用网络模拟,机理,靶标,Biomarker等领域有丰富的实践经验。

  • 舒烈波:博士,博士期间与中科院大连化物所代谢组学研究中心、中科院植物生理生态研究所等多家单位开展交流学习,开展了以转录组、蛋白组、代谢组为基础的植物响应逆境的系统生物学研究,在Proteomics(当期封面文章),JIPB等杂志发表SCI多篇。现为上海博苑生物科技有限公司(博苑多维组学技术服务中心)技术总监,协助广大科研人员在MCP、JPR、Proteomics、J.Proteomics、Metabolomics、Plos One等几乎所有主要蛋白质组领域杂志发表研究论文百余篇,在蛋白质组实验设计、技术以及相应的数据整理分析和论文投稿方面都有较丰富的经验。

  • 俞志浩:博士,赛默飞世尔科技(Thermo)资深应用专家,于加州大学戴维斯分校获得博士学位,留学期间从事质谱蛋白质组学方面的研究多年,在蛋白质结构功能和质谱蛋白质组学方面积累了丰富的理论知识和实践经验。现负责蛋白质组学试剂产品的应用支持,专注于蛋白质组学样品处理及定量组学技术。

报名链接点这里

培训日程:

日期 时间 授课题目 授课内容
1月5日(周一) 08:30-09:30 
1h
报到
开班仪式
安装软件
测试网络
09:30-11:30
2h
蛋白质学技术,策略和实验设计范例,趋势
讲座
1. 蛋白组学原理、常规策略及实验设计
2. 定量蛋白质组iTRAQ技术应用进展及实验设计范例
3. TMT技术在多重定量蛋白质组研究中的应用策略及实例
11:30-13:00  欢迎午宴
13:00-15:00 
2h
蛋白组学数据分析--预处理
上机实践
1.了解蛋白组数据格式
2. 筛选差异数据
3. 蛋白ID向模式生物映射
4. 使用BLAST工具寻找同源蛋白
15:00-17:30
2.5h
蛋白组学数据分析--注释和富集分析
上机实践
1. 蛋白富集分析
2. 绘制富集分析图
3. 绘制聚类图
4. 针对特定生物意义绘制热图
1月6日(周二) 08:30-11:30 
3h
主流生物信号通路数据库介绍
蛋白相互作用算法和数据库解析
上机实践
1. 通路和网络介绍以及在组学研究中的应用
2. KEGG数据库使用
3. STRING数据库的使用
11:30-13:00  午餐及午间交流
13:00-14:30
1.5h
蛋白组学数据分析——通路富集
上机实践
1. KEGG数据的使用,为数据添加颜色
2. 整合关联GO和KEGG,构建调控模型
14:30-16:30 
2h
蛋白-蛋白相互作用网络绘制 1. 蛋白相互作用网络(PPI)数据的获取
2. 整合PPI和KEGG,构建调控模型
3. 运用cytoscape进行模型构建
16:30-17:30 
1h
总结答疑  
1月7日(周三) 08:30-9:30
1h
高级数据分析
上机实践
1. 蛋白-蛋白互作网络拓展
2. 网络简化,模型绘制
9:30-11:30
2h
混合组学数据分析介绍 1. 蛋白组与转录组结合
2. 蛋白组与代谢组结合
11:30-13:00  午餐及午间交流
13:00-16:00
3h
从公共数据到专业数据库(基于IPA软件) 1. 批量分析蛋白功能、蛋白互作与通路富集
2. 蛋白组与代谢组和转录组联合分析
3. 基于IPA的转录调控分析
16:00-17:00
1h
总结答疑  

报名链接点这里

注:

1.课程具体安排以报名当天的课程表为准。

2.学员请自备电脑。
3.本次培训班费用可抵扣后续服务项目款,抵扣比例为50%

收费标准(含培训资料和午餐):

单人价格: 3500元

两人优惠价格:6000元

三人优惠价格:8000元

其他事项:
1.发票于培训结束前发放

2.2014年12月31日报名截止,培训班视收到学员培训费汇款信息凭证(截图、扫描件)为成功报名,并根据按学员付款先后顺序安排上课及上机位置

3.交通住宿费用自理,住宿需提前一周预定。

住宿建议:

1)嘉善罗星阁君澜宾馆(五星酒店),浙江嘉善车站南路335号,标间/大床(博苑生物优惠价): 358元(含早)T:4006000676

2)嘉善城市宾馆(快捷酒店),嘉善解放东路79号,标间/大床(博苑生物优惠价):190元(含早),T:13957399328,0573-84038888

4.推荐旅游景点:西塘古镇、乌镇古镇

联系人:冯老师

电话:400-610-1188

邮箱:cphiservice@ubmsinoexpo.com

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