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第七期生物数据分析技能实训会

时间:2018/01/12-2018/01/14
地点:安徽合肥
地区:中国 安徽省 合肥
主办单位:

培训日程(所有课程均含上机实践):

日期

时间

授课题目 授课内容
1月11日

16:00-21:00

报到(外地学员)  
1月12日

08:00-08:30

报到(本地学员)  

08:30-09:00

预装软件、调试网络  

09:00-12:00 

核酸信息注释 NCBI数据库常用资源:Nucleotide、Gene、Unigene子数据库的功能及信息注释;常见序列格式的转换。
EBI数据库常用资源:Ensembl、HGNC、Expression Atlas子数据库的功能及信息注释。
基因结构注释在线工具:内含子剪切位点、可变剪接、启动子序列、转录因子结合位点。

14:00-18:00

蛋白质信息注释 蛋白质序列数据库:UniProt数据库、PIR数据库的功能及信息注释。
蛋白质相互作用数据库:String数据库、IntAct数据库的信息注释。
蛋白质结构数据库:PDB数据库的信息注释
1月13日

09:00-12:00

非编码RNA信息注释及靶基因预测 miRBase/TargetScan数据库:miRNA信息注释及靶基因预测
Noncode/LncRNAdb数据库:LncRNA信息注释及靶基因预测

14:00-18:00

基因集功能富集分析 Gene Ontology、KEGG pathway数据库的信息注释
利用DAVID在线工具富集分析基因集功能
利用Excel软件/Venn在线工具绘制基因集功能富集图及维恩图(Venn分析)
1月14日

09:00-12:00

基因表达数据处理与分析 利用ArrayTools软件处理从NCBI GEO子数据库下载的表达数据
利用Cluster/Treeview软件进行聚类分析
利用FunNet在线工具进行共表达网络分析

14:00-17:00

交互作用网络数据可视化分析 利用Cytoscape软件进行关联基因注释、文献检索及其交互关系、分子间相互作用及基因表达图形化分析。

电话:400-610-1188

邮箱:cphiservice@ubmsinoexpo.com

官网:http://www.huasitai.com/index.php?mod=info&id=433

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