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CPHI制药在线 资讯 1株南极来源真菌 Arthrinium arundinis 的次级代谢产物研究
1株南极来源真菌 Arthrinium arundinis 的次级代谢产物研究
来源:药智网
  2023-11-29
南极位于地球最南端,气候严寒,风力凛冽,太阳辐射强烈,生存条件严苛,其特有的冻层海洋环境使其蕴藏着十分独特的微生物资源[1]。为了适应极地特有的环境,这些微生物在基因的转录、蛋白的表达及代谢调控方面有着独特的机制,具有产生结构新颖活性化合物的潜力[2-4]。文献研究表明,节菱孢属真菌Arthrinium sp.能够产生多样的次级代谢产物,涵盖了苯并色原酮类[5-6]、香豆素类[7-8]、生物碱类[9-10]、萜类[11]、甾体类[12]等,且这些化合物具有抗菌、抗病毒、细胞毒等生物活性。

       南极位于地球最南端,气候严寒,风力凛冽,太阳辐射强烈,生存条件严苛,其特有的冻层海洋环境使其蕴藏着十分独特的微生物资源[1]。为了适应极地特有的环境,这些微生物在基因的转录、蛋白的表达及代谢调控方面有着独特的机制,具有产生结构新颖活性化合物的潜力[2-4]。文献研究表明,节菱孢属真菌Arthrinium sp.能够产生多样的次级代谢产物,涵盖了苯并色原酮类[5-6]、香豆素类[7-8]、生物碱类[9-10]、萜类[11]、甾体类[12]等,且这些化合物具有抗菌、抗病毒、细胞毒等生物活性。

       本研究对南极来源真菌Arthrinium arundinis(FNJ20)的次级代谢产物及其生物活性开展研究,从中分离鉴定出1个新构型的二萜类化合物(–)arthrinin A(1),5个已知二萜类化合物libertellenone J(2),arthrinins B(3),arthrinin D(4),myrocin A(5),myrocin E(6)以及2个苯并色原酮类化合物conioxanthone A(7),1,3,6-tri-hydroxy-8-methylxanthone(8)(见图1),并对化合物进行了抗菌活性评价。

《中国海洋药物》

       01

       实验部分

       1.1仪器与试剂

       LaChrom Elite高效液相色谱仪(日本日立公司);Micromass Q-TOF质谱仪(美国Waters公司);Agilent DD2 500 MHz型核磁共振波谱仪(美国Agilent公司);X-单晶衍射仪(德国Bruker公司);Laborota 2 000/4 000旋转蒸发仪(德国Heidoph公司);MIR-253 SANYO恒温培养箱(上海精宏实验设备有限公司);酶联免疫检测仪(奥地利Tecan公司);LDZX-50KBS高压蒸汽灭菌锅(上海申安医疗器械厂);Sephadex LH-20凝胶色谱填料(美国Amersham公司);硅胶(200~300目,青岛海洋化学公司)。

       酵母膏,琼脂,葡萄糖,甘油,DMSO(国药集团化学试剂有限公司);环丙沙星(上海麦克林生化科技有限公司,生产批号201424);高效液相色谱仪专用色谱纯甲醇(天津四友精细化工公司);氘代试剂(美国CIL公司);提取分离所用甲醇、乙酸乙酯、二氯甲烷、石油醚等均为工业纯产品。

       1.2菌株来源

       菌株分离自南极海泥。经过真菌形态和ITS序列比对,确定为真菌Arthrinium arundinis。目前该菌株保存于中国海洋大学海洋药用生物资源室,菌株编号为FNJ20,于甘油中?80℃保存。

       1.3菌株发酵

       从节菱孢属真菌A.arundinis(FNJ20)菌种冻存管中,将菌种接种到土豆培养基(PDA)平板上复苏,然后将平板上复苏好的菌株琼脂小块接种到大米固体培养基(30 g大米,30 g/1 000 mL的海水约30 mL)中,共发酵200瓶,室温静置培养45d。

       1.4提取与分离

       将发酵后的菌体用乙酸乙酯浸泡3次,再用二氯甲烷-甲醇(体积比1∶1)浸泡1次,浓缩得到浸膏(270 g)。首先用减压柱对浸膏梯度洗脱,最终获得5个组分(Fr.1~5)。组分Fr.2经过正相柱色谱分离、凝胶柱色谱Sephadex LH-20(洗脱体系为石油醚-二氯甲烷-甲醇,体积比2∶1∶1)分离得到组分Fr.2.1~2.3,组分Fr.2.1经过半制备型高效液相色谱(甲醇-水,体积比9∶1,流速2 mL/min)制备得到化合物1(18.9 mg)。组分Fr.2.3经过半制备型高效液相色谱(甲醇-水,体积比9∶1,流速2 mL/min)制备得到化合物2(15.5 mg)。将组分Fr.3经过硅胶柱色谱分离、凝胶柱层析Sephadex LH-20(洗脱体系为二氯甲烷-甲醇,1∶1),洗脱得到组分Fr.3.1~3.3。组分Fr.3.1经半制备高效液相色谱(甲醇-水,体积比8∶2,流速2 mL/min)得到化合物3(9.8 mg)和4(9.2 mg)。组分Fr.3.2经半制备高效液相色谱(甲醇-水,体积比8∶2,流速2 mL/min)得到化合物5(18.3 mg)和6(7.8 mg)。组分Fr.3.3经半制备高效液相色谱(甲醇-水,体积比7∶3,流速2 mL/min)得到化合物7(15.0 mg)和8(8.2 mg)。

       1.5抗菌活性评价

       以微量稀释法[13-14]进行化合物的抗菌活性测定。测试菌株包括金黄色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)、大肠杆菌(Escherichia coli)、铜绿假单胞菌(Psmdomonas aeruginosa)、白色念珠菌(Candida albicans)。阳性对照为环丙沙星,阴性对照为DMSO溶液,每个化合物设置3个平行。

       02

       结果与讨论

       2.1化合物的结构鉴定

       化合物1:无色晶体,HRESIMS在m/z 327.158 9处给出[M+H]+峰,确定分子式为C20H22O4,不饱和度为10。在其1 H NMR和13C NMR谱中,δH 1.01(1H,t,J=4.40 Hz,H-20a)和δH 0.68(1H,dd,J=8.55,4.75 Hz,H-20b)处的氢信号及δC 14.5(C-20)、δC 21.3(C-1)和δC 23.3(C-10)处的碳信号,提示了化合物1有环丙基结构。此外,还有1个羰基信号(δC 182.7),1个末端乙烯基信号δC 136.1,δH 6.94(1H,dd,J=11.24,17.98 Hz,H-15);δC 120.7,δH 5.39(1H,dd,J=11.24,2.32 Hz,H-16a)和δH 5.10(1H,dd,J=17.98,2.32 Hz,H-16b),2个次甲基信号和2个甲基信号。根据以上的核磁数据推测化合物1为二萜类化合物,且该化合物的波谱数据与文献报道已知化合物arthrinin A一致[15],由此1的平面结构得以确定。以正己烷-甲醇(体积比1∶1)溶解化合物,室温缓慢挥发溶剂获得单晶,通过铜靶单晶衍射获得其单晶数据(见图2),并已经提交到剑桥晶体数据中心,CCDC号为1992569。对单晶数据进行分析确定化合物1的一定构型为1S,4S,5R,6R,7R,10S,与文献报道的arthrinin A的构型相反,最终将化合物1命名为(–)-arthrinin A。

图2 化合物1的晶体结构图

       化合物2~6:均为已知的二萜类化合物,其质谱、核磁及旋光数据与文献报道一致,分别确定为libertellenone J(2)[16],arthrinin B(3)[15],arthrinin D(4)[15],myrocin A(5)[17]和myrocinE(5)[16]。

       化合物7:白色粉末状固体。ESI-MS在m/z 317处给出[M+H]+峰,提示分子质量为316。1H NMR谱显示了4个均为单峰的芳香氢信号(δH 6.73,6.74,6.82,6.94),13C NMR谱显示了2个苯环上连羟基的碳信号(δC 162.9,167.9)和1个羰基碳信号(δC 181.0),这提示了苯并色原酮骨架的存在。另外,1H NMR和13C NMR谱还显示了1个甲氧基(δC 53.6,δH 3.96),1个亚甲基(δC64.6,δH 4.67)的存在。结合以上信息,对比文献[18]的核磁数据,确定了化合物为conioxanthone A。化合物8:黄色粉末状固体。ESI-MS在m/z259处给出[M+H]+峰,提示分子质量为258。其1H NMR和13C NMR数据与7的相似,也显示了苯并色原酮骨架特征信号。结合以上信息,对比文献[19]的核磁数据,确定了化合物为1,3,6-tri-hydroxy-8-methylxanthone。

       2.2化合物波谱数据

       Arthrinin A(1):C20H22O4,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 6.94(1H,dd,J=11.24,17.98 Hz,H-15),6.48(1H,s,H-12),5.39(1H,dd,J=11.24,2.32 Hz,H-16a),5.24(1H,d,J=7.76 Hz,H-7),5.10(1H,dd,J=17.98,2.32 Hz,H-16b),4.52(1H,dd,J=11.94,7.76 Hz,H-6),3.18(1H,ddt,J=8.91,4.11,2.56 Hz,H-1),2.19(1H,d,J=11.94 Hz,H-5),2.16(3H,s,H-17),2.03(1H,m,H-2a),1.83(1H,dq,J=14.08,3.10 Hz,H-2b),1.57(1H,td,J=13.73,3.75 Hz,H-3a),1.43(1H,m,H-3b),1.27(3H,s,H-18),1.01(1H,t,J=4.40 Hz,H-20a),0.68(1H,dd,J=8.55,4.75 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 182.7(C-19),150.2(C-11),139.2(C-8),136.1(CH-15),135.0(C-13),132.4(C-14),129.9(C-9),120.7(CH2-16),117.3(CH-12),84.9(CH-6),74.4(CH-7),47.0(CH-5),39.1(C-4),27.8(CH3-18),23.3(C-10),22.8(CH2-3),21.3(CH-1),20.5(CH2-2),20.2(CH3-17),14.5(CH2-20)。HRESIMS m/z 327.158 9[M+H]+,m/z 349.140 8[M+Na]+,m/z 365.115 1[M+K]+,[α]2 5 D–7.87(c=0.1,MeOH)。

       Libertellenone J(2):C21H28O6,1 H NMR(500MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 7.00(1H,d,J=1.87 Hz,H-14),5.93(1H,dd,J=17.49,10.67 Hz,H-15),5.13(1H,dd,J=17.49,1.05 Hz,H-16a),5.06(1H,dd,J=10.67,1.05 Hz,H-16b),4.35(1H,dd,J=10.95,4.76 Hz,H-1),3.64(3H,s,H-21)2.23(1H,td,J=14.50,3.32 Hz,H-11a),2.10(1H,dt,J=14.50,3.32 Hz,H11b),1.96(1H,dd,J=13.13,3.88 Hz,H-3a),1.88(1H,m,H-2),1.81(1H,m,H-12),1.65(1H,ddd,J=12.83,4.21,2.18 Hz,H-3b),1.57(1H,m,H-12),1.50(3H,s,H-18),1.22(3H,s,H-20),1.16(3H,s,H-17)。13C NMR(151 MHz,Methanol-d4,δ)δC 182.9(C-7),180.3(C19),148.9(CH-14),147.6(CH-15),146.1(C-6),140.5(C-5),135.9(C-8),112.8(CH2-16),76.4(C-9),69.7(CH-1),52.9(CH3-21),50.3(C-10),47.6(C-4),39.7(C-13),35.3(CH2-3),31.0(CH2-12),29.8(CH2-11),28.7(CH2-2),23.8(CH3-17),22.3(CH3-18),22.9(CH3-20)。ESI-MS m/z:377[M+H]+,[α]2 5 D–32.7(c=0.1,MeOH)。

       Arthrinin B(3):C20H22O3,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 7.00(1H,s,H-14),6.61(1H,dd,J=18.08,11.50 Hz,H-15),5.60(1H,dd,J=11.50,1.99 Hz,H-16b),5.41(1H,dd,J=18.08,1.99 Hz,H-16a),4.93(1H,d,J=8.71 Hz,H-7),4.43(1H,dd,J=11.41,8.71 Hz,H-6),3.16(1H,ddt,J=9.00,4.16,2.56 Hz,H-1),2.27(1H,d,J=11.41 Hz,H-5),2.22(3H,s,H-17),2.07(1H,td,J=13.83,3.35 Hz,H-2b),1.84(1H,dq,J=14.11,3.08 Hz,H-2a),1.60(1H,td,J=13.83,3.35 Hz,H-3a),1.46(1H,dt,J=14.11,3.08 Hz,H-3b),1.29(3H,s,H-18),1.02(1H,t,J=4.38 Hz,H-20a),0.60(1H,dd,J=8.60,4.71 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 183.6(C-19),149.0(C-11),139.1(C-8),133.4(C-13),131.5(CH-15),130.1(CH-9),125.2(C-12),122.7(CH-14),120.1(CH2-16),85.5(CH-6),75.5(CH-7),47.2(CH-5),39.0(C-4),27.1(CH3-18),23.6(C-10),22.7(CH2-3),21.3(CH-1),20.0(CH2-2),19.2(CH3-17),14.0(CH2-20)。ESIMS m/z 311[M+H]+,[α]2 5 D+14.2(c=0.1,MeOH)。

       Arthrinin D(4):C20H24O5,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 6.73(1H,dd,J=17.84,11.34 Hz,H-15),6.56(1H,d,J=0.92 Hz,H-12),5.49(1H,dd,J=11.34,2.29 Hz,H-16a),5.34(1H,dd,J=17.84,2.29 Hz,H-16b),5.13(1H,s,H-7),3.58(1H,q,J=7.05 Hz,H-6),2.15(3H,s,H-17),2.32(1H,s,H-5),1.99(1H,tdd,J=12.49,4.54,2.48 Hz,H-3a),1.77(1H,m,H-3b),1.72(1H,dd,J=14.37,4.68 Hz,H-2a),1.45(1H,ddd,J=14.37,4.46,2.48 Hz,H-2b),1.38(3H,s,H-18),1.15(1H,t,J=7.05 Hz,H-1),0.89(1H,t,J=5.51 Hz,H=20a),0.43(1H,dd,J=8.43,5.89 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 183.3(C-19),152.3(C-11),137.3(C-9),134.6(C-14),134.2(CH-15),131.2(C-8),118.8(CH2-16),117.8(CH-12),72.0(CH-7),57.0(CH-6),52.6(CH-5),41.7(C-4),28.2(CH3-18),26.8(CH2-2),19.3(CH3-17),18.6(CH2-3),17.9(C-13),17.0(CH-1),16.6(C-10),14.3(CH2-20)。ESI-MS m/z:345[M+H]+,367[M+Na]+,[α]2 5 D+24.6(c=0.1,MeOH)。

       Myrocin A(5):C20H22O6,1 H NMR(500 MHz,Acetone-d6,δ,J/Hz)δH 6.83(1H,d,J=1.57 Hz,H-14),5.69(1H,dd,J=17.67,10.31 Hz,H-15),5.01(1H,d,J=1.38 Hz,H-16a),4.98(1H,dd,J=5.00,0.75 Hz,H-16b),2.90(1H,d,J=13.42 Hz,H-12a),2.52(1H,dd,J=13.42,1.57 Hz,H-12b),2.07(1H,m,H-2a),1.84(1H,m,H-2b),1.82(1H,m,H-3a),1.79(1H,m,H-1),1.44(1H,m,H-3b),1.43(3H,s,H-17),1.42(3H,s,H-19),1.09(1H,t,J=6.28 Hz,H-20a),0.83(1H,dd,J=8.97,6.28 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Acetone-d6,δ)δC 208.8(C-11),182.9(C-7),177.8(C-19),145.1(C-6),143.8(CH-14),142.7(CH-15),137.5(C-8),132.6(C-5),115.2(CH2-16),76.7(C-9),53.9(CH2-12),44.9(C-4),43.3(C-13),29.8(CH2-3),27.6(C-10),27.5(CH3-17),20.0(CH3-18),18.2(CH2-2),16.9(CH-1),12.4(CH2-20)。ESI-MS m/z:359[M+H]+,381[M+Na]+,[α]2 5 D–32.1(c=0.1,MeOH)。

       Myrocin E(6):C20H24O6,1 H NMR(500 MHz,Acetone-d6,δ,J/Hz)δH 6.82(1H,d,J=1.43 Hz,H-14),5.83(1H,dd,J=17.47,10.57 Hz,H-15),5.03(1H,dd,J=17.47,1.10 Hz,H-16a),4.98(1H,dd,J=10.57,1.10 Hz,H-16b),3.91(1H,d,J=3.93 Hz,H-11),3.47(1H,d,J=1.13 Hz,H-5),2.87(1H,m,H-12a),2.36(1H,dd,J=14.27,2.49 Hz,H-1),1.78(1H,m,H-3a),1.76(1H,m,H-2a),1.74(1H,m,H-2b),1.66(1H,ddd,J=14.25,3.72,1.43 Hz,H-12b),1.48(3H,s,H-19),1.44(1H,m,H-3b),1.33(3H,s,H-17),0.63(1H,dd,J=6.33,3.99 Hz,H-20a),0.14(1H,t,J=14.87 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Acetone-d6,δ)δC 193.3(C-7),182.9(C-18),148.4(CH-14),147.4(CH-15),133.7(C-8),112.3(CH2-16),97.2(C-6),72.7(C-9),69.4(CH-11),47.3(CH-5),41.8(C-4),39.7(C-13),39.1(CH2-12),29.7(CH3-19),29.6(CH2-3),27.2(CH3-17),25.1(C-10),19.5(CH2-2),14.4(CH-1),7.4(CH2-20)。ESI-MS m/z:361[M+H]+,383[M+Na]+,[α]2 5 D–8.37(c=0.1,MeOH)。

       Conioxanthone A(7):C16H12O7,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 6.94(1H,s,H-4),6.82(1H,s,H-5),6.74(1H,s,H-7),6.73(1H,s,H-2),4.67(2H,s,H-10),3.96(3H,s,H-12)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 181.0(C-9),171.7(C-11),167.9(C-6),162.9(C-1),160.1(C-5a),157.6(C-4a),153.6(C-3),136.7(C8),115.0(CH-7),109.0(CH-2),108.4(C-8a),108.1(C-1a),105.4(CH-4),104.7(CH-5),64.6(CH2-10),53.6(CH3-12)。ESIMS m/z:339[M+Na]+。

       1,3,6-trihydroxy-8-methylxanthone(8):C14H10O5,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 6.57(1H,s,H-2),6.56(1H,s,H-4),6.08(1H,d,J=2.19 Hz,H-5),6.19(1H,d,J=2.19 Hz,H-7),2.74(3H,s,H-11)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 183.6(C-9),166.2(C-6),165.0(C-8),164.4(C-3),161.0(C-4a),158.8(C-10a),144.9(C-1),117.2(CH-2),113.0(C-1a),104.2(C-9a),101.7(CH-4),99.0(CH-7),94.4(CH-5),23.7(CH3-11)。ESIMS m/z:259[M+H]+。

       2.3化合物1单晶数据

       C20H22O4(M),Mr=326.37,该晶体为单斜晶,所在空间群为P2(1);晶胞参数为a=10.199 8(5)?,b=7.157 7(4)?,c=11.739 4(6)?,α=90°,β=103.098(5)°,γ=90°,V=834.76(8),Z=2,Dcalc=1.298 g/cm3,μ(Cu Kα)=0.726 mm–1,F(000)=348.0。独立衍射点:5110(Rint=0.032 0)。R1值为0.038 6,flack常数为0.1(3),wR2=0.099 5[I>2σ(I)],化合物1的单晶数据已经提交到剑桥单晶数据中心,CCDC号为1992569。

       2.4抗菌活性评价

       采用微量稀释法对分离到的化合物进行抗菌活性评价。结果显示,化合物8具有对金黄色葡萄球菌和白色念珠菌显著的抑制活性,MIC值分别为6.25和12.50μmol/L。阳性对照环丙沙星的MIC值为3.125μmol/L。

       03

       结论

       本研究从南极海泥来源节菱孢属真菌A.arundinis(FNJ20)的发酵提取物中分离并鉴定了6个二萜类化合物(1~6)及2个苯并色原酮类化合物(7~8),并通过单晶确定了化合物1的一定构型。化合物8对金黄色葡萄球菌和白色念珠菌有显著的抑制活性,为该菌次级代谢产物的进一步应用提供了基础资料。

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