第七期生物数据分析技能实训会
培训日程(所有课程均含上机实践):
日期 |
时间 |
授课题目 | 授课内容 |
1月11日 |
16:00-21:00 |
报到(外地学员) | |
1月12日 |
08:00-08:30 |
报到(本地学员) | |
08:30-09:00 |
预装软件、调试网络 | ||
09:00-12:00 |
核酸信息注释 | NCBI数据库常用资源:Nucleotide、Gene、Unigene子数据库的功能及信息注释;常见序列格式的转换。 EBI数据库常用资源:Ensembl、HGNC、Expression Atlas子数据库的功能及信息注释。 基因结构注释在线工具:内含子剪切位点、可变剪接、启动子序列、转录因子结合位点。 |
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14:00-18:00 |
蛋白质信息注释 | 蛋白质序列数据库:UniProt数据库、PIR数据库的功能及信息注释。 蛋白质相互作用数据库:String数据库、IntAct数据库的信息注释。 蛋白质结构数据库:PDB数据库的信息注释 |
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1月13日 |
09:00-12:00 |
非编码RNA信息注释及靶基因预测 | miRBase/TargetScan数据库:miRNA信息注释及靶基因预测 Noncode/LncRNAdb数据库:LncRNA信息注释及靶基因预测 |
14:00-18:00 |
基因集功能富集分析 | Gene Ontology、KEGG pathway数据库的信息注释 利用DAVID在线工具富集分析基因集功能 利用Excel软件/Venn在线工具绘制基因集功能富集图及维恩图(Venn分析) |
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1月14日 |
09:00-12:00 |
基因表达数据处理与分析 | 利用ArrayTools软件处理从NCBI GEO子数据库下载的表达数据 利用Cluster/Treeview软件进行聚类分析 利用FunNet在线工具进行共表达网络分析 |
14:00-17:00 |
交互作用网络数据可视化分析 | 利用Cytoscape软件进行关联基因注释、文献检索及其交互关系、分子间相互作用及基因表达图形化分析。 |
电话:400-610-1188
邮箱:cphiservice@ubmsinoexpo.com
官网:http://www.huasitai.com/index.php?mod=info&id=433