褪黑素被熟知的功能主要是可以改善睡眠质量（用量0.1~0.3mg），能缩短睡前觉醒时间和入睡时间，改善睡眠质量，睡眠中觉醒次数明显减少，浅睡阶段短，深睡阶段延长，次日早晨唤醒阈值下降。有较强的调整时差功能 。
褪黑素**大的特点应该是，它是迄今发现的**强的内源性自由基清除剂。褪黑素的基本功能就是参与抗氧化系统，防止细胞产生氧化损伤。在这方面，它的功效超过了已知的所有体内物质。**研究证明，MT是内分泌的总司令，它控制体内各种内分泌腺的活动。从而间接地控制我们全身的机能。它的作用有：
防止病变
由于MT很容易进入细胞，因此可担任保护细胞核DNA的任务。如果DNA受到损害就可能导致癌变。
如果血液中有足够的Mel，就不容易患癌症
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