• 产品
  • 供应商
  • CAS号
  • 采购
  • 资讯
  • 会展活动

热搜关键词: 厂家直销盐酸四环素 氧化铁黄 金红石型钛白粉 伊维菌素 干燥剂价格 >>

您的位置:首页 >> 资讯 >> 研究与发展 >> 浅谈:口服多肽药物开发的关键参数设计

浅谈:口服多肽药物开发的关键参数设计

https://www.cphi.cn   2023-10-27 10:04 来源:药渡网 作者:哥哈骎

       10月19日,笔者在瑞典Lund参加了Öresund Peptide Syposium并做了一场报告。在这个北欧多肽论坛中,笔者注意到了来自西兰制药(Zealand Pharma)的计算化学和机器学习专家Octav Caldararu博士做的有关口服多肽机器学习的报告,阐述了在开发口服多肽的过程中需要注意的几个关键参数。

       10月19日,笔者在瑞典Lund参加了Öresund Peptide Syposium并做了一场报告。在这个北欧多肽论坛中,笔者注意到了来自西兰制药(Zealand Pharma)的计算化学和机器学习专家Octav Caldararu博士做的有关口服多肽机器学习的报告,阐述了在开发口服多肽的过程中需要注意的几个关键参数。

       Octav Caldararu博士在分析了5339个多肽药物或者候选药物之后发现,开发口服多肽需要在以下几个参数方面加以控制:

       氨基酸数量:4-11个氨基酸(环肽或交联直线肽)

       Peff(effective permeability) > 1.0 x 10-6 cm/s

       LogP7.4= 1-5

       HBD: 6-9

       TPSA (Topological Polar Surface Area) ≤ 300 ?2

       他通过一个具体的口服多肽设计案例,说明了以上参数对于多肽口服递送的重要性。他尤其强调了TPSA在设计口服多肽中的关键角色。

       之后笔者又查阅了关于口服多肽的文献,Santos et al在ChemMedChem上发表的Oral Administration of Peptide-Based Drugs: Beyond Lipinski’s Rule,通过详尽的统计学手段,分析了口服多肽在物理化学参数方面的指标特征。他们的结论与Octav Caldararu博士的观点相近,即口服多肽需要在分子量、LogP (亲脂性)、HBD和TPSA方面加以控制。除此之外,Santos还论述了分子刚性和可旋转键数量的重要性。

口服(蓝色)与肠道外(绿色)给药多肽的分子量与亲脂性分布

       上图显示了分子量和亲脂性与多肽药物递送之间的关联。从分布来看,口服多肽的分子量在1200 Da.以下(可以粗略地看作12元肽),而且Log在-5到8之间。因此来看,多肽口服递送在分子量和LogP上,与利平斯基五规则有一定的出入。利平斯基五规则要求分子量小于500 Da., LogP小于5。

       利平斯基五规则

       亦称里宾斯基五规则,内容为:

       化合物的分子量小于500道尔顿;

       化合物结构中的氢键给体(包括羟基、氨基等)的数量不超过5个;

       化合物中氢键受体的数量不超过10个;

       化合物的脂水分配系数的对数值(logP)在-2到5之间;

       化合物中可旋转键的数量不超过10个。

       简化后的四规则去掉了关于可旋转键的数量限制;三规则进一步去掉了对氢键受体数量的限制。四规则和三规则有时仍然被称作“五规则”,这里的五指的是各条规则的判别值均为5的倍数。

       图2显示了氢键受体数量(HBA)和氢键供体数量(HBD)与递送方式之间的关联。从该图中可以看出,大多数口服多肽的HBA在50以下,HBD在25以下,恰好是利平斯基五规则在各自方面的5倍(HBA不超过10,HBD不超过5)。

口服(蓝色)与肠道外(绿色)给药多肽的HBA和HBD分布

       除了利平斯基五规则的四条规则之外,其他评估多肽药物口服递送的指标还包括:

       分子柔性(通过自由旋转键的数量number of freely rotatable bonds,NRB 来衡量)

       拓扑极性表面积(TPSA, Topological Polar Surface Area)

       sp3杂化碳原子分数(Fsp3,fraction of sp3-hybridized carbon atoms)

       酰胺键与水之间形成氢键,这对于多肽的口服生物利用度和细胞膜渗透具有不利影响,这恰好是多肽分子不利于口服递送的原因之一,因为多肽的肽链骨架就是酰胺。高极性表面积也非常不利于口服递送。

       Veber等人曾经归纳出口服多肽的NRB应该小于10,即刚性对于多肽的口服生物利用度是有利的,这也是像cyclosporine A这样的多肽能够实现口服递送的原因所在,也是多肽环化可能会对口服递送产生积极影响的理论基础。尽管环化可以减少N-端和C-端两个电荷,增加一定的亲脂性,但它的关键作用并不在此,而可能是增加多肽的刚性。

       芳香环、sp3碳和手性碳的特征表明,具有空间三维度,而不是过于“平坦”的多肽有利于口服递送。Fsp3的定义是sp3杂化碳原子数除以总碳数。口服肽的Fsp3小于47%。这是一条没有被列入利平斯基五规则的指标。图3显示了Fsp3和NRB以及口服多肽之间的关联性。数据分析显示,口服多肽的可旋转键NRB通常在20个以下,平均Fsp3为55%。目前,与口服小分子药物相比,NRB增加了100%,Fsp3增加了 8%。

 Fsp3和NRB与多肽口服递送的关联:口服多肽(蓝色)、胃肠道外多肽(绿色)

       Veber等人观察到口服多肽药物的TPSA (拓扑极性表面积)通常小于140?2(图4)。TPSA也是在这次?resund Peptide Symposium的报告中被着重强调的关键参数。

口服多肽(蓝色)和胃肠道外多肽(绿色)的拓扑极性表面积(TPSA)分布图

       以上口服多肽数据,揭示出了多肽口服递送条件在利平斯基五规则基础上的延伸。具有口服递送潜质的多肽药物,可能会在以下几个指标上所有限制:

       分子量小于700

       0≤ LogP ≤7

       HBD≤5

       TPSA≤200 ?2

       NRB≤20

       除此之外,研究者还给出了不同百分比的口服多肽对应的这些参数数值(表1)。

不同百分位口服多肽的参数数值

      

如果这篇文章侵犯了您的权利,请联系我们。

市场动态更多 >>
主编视角更多 >>
热门标签更多

投稿合作联系方式: Kelly.Xiao@imsinoexpo.com 021-33392297

地址:上海市徐汇区虹桥路355号城开国际大厦7-8楼 200030

CPHI 网上贸易平台: CPHI.cn| Pharmasources.com| CPHI-Online.com
客服热线:  86-400 610 1188 (周一至周五 9: 00-18: 00)