在高效液相分析检测样品的过程中，色谱柱会受到来自于样品及色谱系统的污染，从而导致色谱柱耐用性差、寿命缩短。
来自于色谱系统的污染主要指，HPLC仪器系统中部件磨损而产生的固体颗粒，以及流动相系统过滤不完全残留的固体颗粒。来自于样品的污染主要指，未完全溶解的样品或者已完全溶解的样品进入色谱系统中，由于样品溶剂和流动相溶剂对样品溶解存在的溶解度差异，导致沉淀析出污染系统。特别是对于中药、天然产物、合成中间体及生物药品的检测，因基质的复杂性，色谱柱受污染的情况会更加严重。污染会导致色谱系统压力升高、色谱柱塌陷、填料变色等，从而带来检测成本高，测试结果不准确等各种影响。
保护柱为色谱柱提供方便、经济和有效的保护，延长了色谱柱的寿命，保证分析结果的重现性。随着使用时间的增加，高效液相色谱柱分离效能下降，柱压增高，其原因主要是由于色谱柱进口段的少量填料被污染引起的，而色谱柱整个柱床并未被破坏，使用保护柱，相当于在色谱柱前增加了一段额外的填料，起到了保护整个色谱柱的作用。
