苦参碱与氧化苦参碱是苦参或平科植物广豆根中分离出来的生物碱，药材中以氧化苦参碱为主要成分，含苦参的复方则以苦参碱为主要成分，苦参药材入药后苦参碱与氧化苦参碱存在着相互转化。那么，苦参碱与氧化苦参碱是怎样转化的？
含苦参药材的复方（止痛散、苦参汤）水煮后苦参碱含量高于氧化苦参碱，随着煎煮时间的延长，比例显著加大。科学家研究了苦参在复方中化学成分的变化，结果表明，苦参与丹参、茵陈等配伍煎煮时，药液中检不到氧化苦参碱，而在加水室温超声提取时，TLC可以检出明显的氧化苦参碱斑点。
苦参与黄柏、车前草配伍煎煮，TLC可以检到明显的氧化苦参碱斑点。将氧化苦参碱与原儿茶醛共加热，随着时间延长，TLC图谱中氧化苦参碱斑点逐渐减弱，苦参碱斑点逐渐增强；而氧化苦参碱单独加热5h也未见变化。
科学家同时也发现，苦参与地龙配伍时，氧化苦参碱大部分转化成为苦参碱。据以上结果初步推测，氧化苦参碱转化为苦参碱的必要条件是还原性物质的存在和加热。
通过离体和整体试验观察了人肠内菌对氧化苦参碱的代谢。结果表明，氧化苦参碱于人粪肠内菌厌氧培养后，经24小时代谢转化，大部分氧化苦参碱转化为苦参碱。大鼠灌胃（100mg/kg）氧化苦参碱后3h，经HPLC检测，氧化苦参碱和苦参碱在血中均有发现，苦参碱浓度高于氧化苦参碱，说明体内也存在氧化苦参碱向苦参碱转化。通过LC-MS法同时测定了氧化苦参碱及其代谢物苦参碱在Beagle犬体内的经时过程，二者血药浓度曲线下的面积均值之比约为0.95，表明有大量的氧化苦参碱在肠道经细菌转化为苦参碱而吸收入血。
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