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整合基因组和组织学信息 基因组学公司联手开拓新前沿

https://www.cphi.cn   2018-12-11 11:15 来源:药明康德

今日,10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学(spatial genomics)领域的领先公司。

       今日,10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学(spatial genomics)领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域,它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据,而且可以比较在组织不同部位的细胞中基因组信息的变化。这一技术在肿瘤学、神经科学和免疫学等疾病领域中将有很广泛的应用前景,而且可用于更广范围的生物学研究。

       Spatial Transcriptomics公司的宗旨是在细胞的形态学环境中理解基因表达对更深入地探索基因活性至关重要。该公司的技术平台结合显微成像技术和RNA测序技术,能够从一片完整的冰冻组织切片中,获取切片上不同位置细胞中的完整转录组(transcriptome)数据。

       该平台的工作流程将冰冻组织切片覆盖在特定的玻璃矩阵芯片上。芯片上固定着能够捕获细胞中mRNA的探针。探针上携带的条形码标志出它们在矩阵芯片上的位置。通过这种探针捕捉细胞中mRNA并进行测序的方法,研究人员可以观察到哪些基因在组织的特定位置表达,并且可以定量检测出它们的表达水平。

Spatial Transcriptomics公司技术平台原理示意图

       ▲Spatial Transcriptomics公司技术平台原理示意图(图片来源:参考资料[4])

       “基因组学领域发展迅速,在很短的时间里我们已经从对人类基因组测序进步到对特定组织,甚至是单细胞进行测序,” Spatial Transcriptomics公司联合创始人Joakim Lundeberg教授说:“空间基因组学将是下一个发展前沿。我们很高兴与10x Genomics公司合作,推广这一技术的应用”。

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