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《自然》子刊:人工智能找到了400多个**分裂症相关基因

https://www.cphi.cn   2019-04-03 22:08 来源:学术经纬

 近日,来自西奈山伊坎医学院(Icahn School of Medicine at Mount Sinai)的研究人员使用了一种新的机器学习方法,确定了来自13个大脑区域中的413个**分裂症相关基因。

       近日,来自西奈山伊坎医学院(Icahn School of Medicine at Mount Sinai)的研究人员使用了一种新的机器学习方法,确定了来自13个大脑区域中的413个**分裂症相关基因。这项研究发表在了《Nature Genetics》上,是同类研究中规模的一次,参与人数超过10万人。这项研究使用机器学习算法,从组织水平上检测基因表达,不仅可以识别出与**分裂症相关的新基因,还可以精确定位大脑中可能发生异常表达的区域。

       虽然**分裂症患病率较低,只影响了全球不到2%的人口,但由于其治疗费用较高且病情容易反复,也会造成很大的公共健康隐患。此外,尽管人们认为有很多基因都会增加患**分裂症的风险,但对其确切的遗传基础却知之甚少。因为疾病相关基因的发现对于理解疾病机制尤其重要,所以了解**分裂症的相关基因对这种疾病的诊断和治疗都起到非常关键的作用。

       因此,研究人员使用了全基因组关联研究及转录组学插补法,利用组织分辨率来识别**分裂症相关的疾病。 全基因组关联研究是生物医学研究中越来越常见的研究类型,通过识别遗传密码中不同位点的差异,来观察具有特定特征(如**分裂症)的人群中是否可以发现更多的变异。转录组学插补法是一种新型的机器学习技术,通过这种方法,研究人员能够检测疾病和其它组织(比如大脑)中基因表达之间的关联。

       研究人员对40299名**分裂症患者和62264名相匹配的对照样本进行了研究,结果发现与**分裂症相关的基因在患者整个成长发育过程中都有表达:有一些表达发生在怀孕的特定阶段,另外一些表达是在青春期或成年后发生。研究人员还了解到,大脑的不同区域与不同的**分裂症风险相关联,而大多数关联来自背外侧前额叶皮层。

       “我们研发的新预测模型为研究**分裂症的预测基因表达,以及确定与疾病相关的新风险基因,提供了前所未有的力量,”来自西奈山伊坎医学院的遗传学、基因组科学和**病学助理教授 Laura Huckins 博士表示:“通过结合转录组学插补和全基因组关联研究,我们希望不仅可以阐明与**分裂症相关的基因发展,而且能够为未来的研究方法与设计奠定基础。”

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