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CRISPR发现了癌症的重大变化,基因融合或许成为重要药物靶点

https://www.cphi.cn   2019-05-21 22:18 来源:生物探索

CRISPR揭示一种新的基因融合体,不仅能为多种癌症提供新的药物靶点,还有助于构建癌症依赖性地图,为未来癌症精确治疗提供新的研究动力。

        基因融合(Fusion gene),由两个不同的基因异常结合而引起的,在癌症的发生过程中起着重要的作用。通常,它们被用作为预测特定癌症患者药物反应以及预后的诊断工具,以评估患者的最佳治疗结果。它们也是一些最新癌症治疗的重要药物靶点。

        到目前为止,研究人员已经确定了大约20,000个基因融合,但是它们在发展癌症中的确切功能和作用我们仍然知之甚少。因此,区分基因融合是否对癌症存活有影响,具有重要的临床意义。

        近日,《Nature Communications》杂志上刊载了一篇关于基因融合的最新研究。研究人员利用CRISPR基因编辑技术, 揭示了能够对癌细胞生长起到至关重要作用的基因融合类型,并且发现了一种新的基因融合,可以为包括脑癌和卵巢癌在内的多种癌症提供新的药物靶点。

        首次基因融合的大规模研究

        作为对基因融合功能的首次大规模研究, Wellcome Sanger研究所联合EMBL-EBI研究所、 Open Targets平台、GSK公司及其合作者共同分析了来自43种不同癌症类型(包括儿科癌症和临床需求未得到满足的癌症)的1,000多种人类癌细胞系中的8000多种基因融合。

        之后,他们利用350多种抗癌药物来对这些细胞系进行测试,以确定现有的可以用于治疗潜在基因融合相关癌症的药物,并利用CRISPR工具来寻找哪些关键基因融合对癌细胞的存活至关重要。

        研究小组发现,90%的基因融合在癌症中并不起重要作用,但当从病人肿瘤的基因组序列推断癌症的原因时,这些结果应该被考虑。第一作者、Wellcome Sanger研究所的Gabriele Picco博士说:“随着对患者的肿瘤进行基因组测序变得更普遍,那些对于数据进行解读的人必须要更加小心,需要考虑是否存在特定基因融合驱动了癌症的发展。

        Wellcome Sanger研究所和Open Targets平台的Mathew Garnett博士表示:“我们还发现了对癌症存活发挥关键作用的一些基因融合。这些基因变化可能为现有药物治疗患者带来新的机会,也可能会成为未来新的药物靶点。目前,我们发现了一种新的基因融合——YAP1-MAML2,它为包括卵巢癌在内的几种癌症提供了一种新的药物靶点。”

        研究结果还表明,包括RAF1、ROS1和BRD4的基因融合体均可能是现有药物的靶向。这意味着,患有罕见亚型胰 腺癌,乳腺癌和肺癌的患者将拥有新的治疗

        海德堡大学的Julio Saez-Rodriguez博士对此结果十分感兴趣。他说,这项研究有助于进一步利用基因融合体作为治疗性生物标记,并将患者分类进行临床试验,促进更有针对性和更高效的临床研究方法。

        今后,Sanger,EMBL-EBI和Open Targets以及 GSK的研究人员将合作促进这些研究成果转化,为新的治疗方法带来契机。这一研究有助力于建立癌症依赖性地图,以及形成未来癌症精确治疗方案。

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